Protein–RNA interactions for Protein: P25103

TACR1, Substance-P receptor, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TACR1P25103 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TACR1P25103 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TACR1P25103 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TACR1P25103 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TACR1P25103 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TACR1P25103 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TACR1P25103 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TACR1P25103 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TACR1P25103 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TACR1P25103 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TACR1P25103 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TACR1P25103 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TACR1P25103 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TACR1P25103 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TACR1P25103 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TACR1P25103 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TACR1P25103 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TACR1P25103 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TACR1P25103 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TACR1P25103 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TACR1P25103 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TACR1P25103 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TACR1P25103 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TACR1P25103 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TACR1P25103 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TACR1P25103 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TACR1P25103 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TACR1P25103 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TACR1P25103 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TACR1P25103 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TACR1P25103 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TACR1P25103 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TACR1P25103 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TACR1P25103 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TACR1P25103 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TACR1P25103 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TACR1P25103 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TACR1P25103 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TACR1P25103 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TACR1P25103 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TACR1P25103 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TACR1P25103 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TACR1P25103 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TACR1P25103 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TACR1P25103 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TACR1P25103 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TACR1P25103 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TACR1P25103 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TACR1P25103 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TACR1P25103 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TACR1P25103 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TACR1P25103 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TACR1P25103 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TACR1P25103 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TACR1P25103 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TACR1P25103 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TACR1P25103 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TACR1P25103 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TACR1P25103 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TACR1P25103 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TACR1P25103 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TACR1P25103 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TACR1P25103 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TACR1P25103 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TACR1P25103 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TACR1P25103 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TACR1P25103 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TACR1P25103 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TACR1P25103 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TACR1P25103 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TACR1P25103 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TACR1P25103 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TACR1P25103 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TACR1P25103 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TACR1P25103 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TACR1P25103 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TACR1P25103 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TACR1P25103 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TACR1P25103 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TACR1P25103 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TACR1P25103 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TACR1P25103 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TACR1P25103 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TACR1P25103 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TACR1P25103 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TACR1P25103 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TACR1P25103 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TACR1P25103 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TACR1P25103 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TACR1P25103 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TACR1P25103 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TACR1P25103 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TACR1P25103 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TACR1P25103 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TACR1P25103 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TACR1P25103 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TACR1P25103 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TACR1P25103 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TACR1P25103 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TACR1P25103 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms