Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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