Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD247P20963 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD247P20963 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD247P20963 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD247P20963 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD247P20963 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD247P20963 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD247P20963 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD247P20963 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD247P20963 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CD247P20963 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD247P20963 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD247P20963 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD247P20963 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD247P20963 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD247P20963 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD247P20963 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD247P20963 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD247P20963 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD247P20963 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD247P20963 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD247P20963 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD247P20963 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD247P20963 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD247P20963 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD247P20963 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD247P20963 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD247P20963 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD247P20963 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD247P20963 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD247P20963 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD247P20963 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD247P20963 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD247P20963 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD247P20963 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD247P20963 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD247P20963 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD247P20963 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD247P20963 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD247P20963 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD247P20963 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD247P20963 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD247P20963 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD247P20963 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD247P20963 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CD247P20963 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD247P20963 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CD247P20963 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD247P20963 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD247P20963 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD247P20963 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD247P20963 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD247P20963 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD247P20963 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD247P20963 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD247P20963 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD247P20963 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD247P20963 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD247P20963 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD247P20963 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD247P20963 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD247P20963 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD247P20963 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD247P20963 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD247P20963 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD247P20963 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD247P20963 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD247P20963 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD247P20963 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD247P20963 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD247P20963 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD247P20963 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CD247P20963 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CD247P20963 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CD247P20963 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD247P20963 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD247P20963 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD247P20963 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD247P20963 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD247P20963 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD247P20963 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD247P20963 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD247P20963 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD247P20963 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD247P20963 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD247P20963 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD247P20963 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD247P20963 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD247P20963 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD247P20963 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD247P20963 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD247P20963 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD247P20963 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD247P20963 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD247P20963 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD247P20963 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD247P20963 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD247P20963 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD247P20963 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CD247P20963 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms