Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HLA-DPA1P20036 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms