Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TNNI3P19429 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNNI3P19429 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms