Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC5A1P13866 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms