Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI4P10075 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI4P10075 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI4P10075 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI4P10075 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI4P10075 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI4P10075 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI4P10075 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI4P10075 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI4P10075 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI4P10075 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI4P10075 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI4P10075 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI4P10075 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI4P10075 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI4P10075 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI4P10075 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI4P10075 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI4P10075 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GLI4P10075 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GLI4P10075 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GLI4P10075 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GLI4P10075 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GLI4P10075 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GLI4P10075 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GLI4P10075 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GLI4P10075 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GLI4P10075 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GLI4P10075 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GLI4P10075 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GLI4P10075 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GLI4P10075 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GLI4P10075 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GLI4P10075 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GLI4P10075 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GLI4P10075 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GLI4P10075 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GLI4P10075 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GLI4P10075 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GLI4P10075 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GLI4P10075 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GLI4P10075 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GLI4P10075 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GLI4P10075 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GLI4P10075 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GLI4P10075 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GLI4P10075 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GLI4P10075 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GLI4P10075 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GLI4P10075 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GLI4P10075 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GLI4P10075 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GLI4P10075 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GLI4P10075 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GLI4P10075 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GLI4P10075 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GLI4P10075 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GLI4P10075 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GLI4P10075 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GLI4P10075 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GLI4P10075 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GLI4P10075 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GLI4P10075 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GLI4P10075 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GLI4P10075 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GLI4P10075 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GLI4P10075 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GLI4P10075 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GLI4P10075 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GLI4P10075 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GLI4P10075 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GLI4P10075 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GLI4P10075 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GLI4P10075 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GLI4P10075 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GLI4P10075 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GLI4P10075 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GLI4P10075 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GLI4P10075 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GLI4P10075 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GLI4P10075 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GLI4P10075 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GLI4P10075 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GLI4P10075 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GLI4P10075 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GLI4P10075 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GLI4P10075 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GLI4P10075 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GLI4P10075 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GLI4P10075 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GLI4P10075 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GLI4P10075 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GLI4P10075 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GLI4P10075 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GLI4P10075 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GLI4P10075 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GLI4P10075 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GLI4P10075 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GLI4P10075 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GLI4P10075 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms