Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2AF1L5P0DN76 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2AF1L5P0DN76 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2AF1L5P0DN76 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2AF1L5P0DN76 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2AF1L5P0DN76 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2AF1L5P0DN76 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2AF1L5P0DN76 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2AF1L5P0DN76 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2AF1L5P0DN76 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2AF1L5P0DN76 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
U2AF1L5P0DN76 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
U2AF1L5P0DN76 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2AF1L5P0DN76 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2AF1L5P0DN76 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2AF1L5P0DN76 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2AF1L5P0DN76 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2AF1L5P0DN76 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2AF1L5P0DN76 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms