Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB7P09629 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms