Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSLP07711 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTSLP07711 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTSLP07711 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTSLP07711 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTSLP07711 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSLP07711 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSLP07711 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSLP07711 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSLP07711 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSLP07711 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSLP07711 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSLP07711 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSLP07711 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSLP07711 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSLP07711 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSLP07711 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSLP07711 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSLP07711 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSLP07711 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSLP07711 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSLP07711 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSLP07711 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSLP07711 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSLP07711 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSLP07711 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSLP07711 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSLP07711 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSLP07711 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSLP07711 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTSLP07711 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSLP07711 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSLP07711 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSLP07711 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSLP07711 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSLP07711 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSLP07711 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSLP07711 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSLP07711 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSLP07711 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSLP07711 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSLP07711 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSLP07711 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSLP07711 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSLP07711 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSLP07711 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSLP07711 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSLP07711 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSLP07711 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSLP07711 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSLP07711 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSLP07711 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSLP07711 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSLP07711 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSLP07711 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSLP07711 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSLP07711 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSLP07711 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSLP07711 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSLP07711 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSLP07711 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTSLP07711 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSLP07711 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSLP07711 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSLP07711 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSLP07711 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSLP07711 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSLP07711 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSLP07711 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSLP07711 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSLP07711 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSLP07711 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSLP07711 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSLP07711 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSLP07711 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSLP07711 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSLP07711 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSLP07711 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSLP07711 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSLP07711 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSLP07711 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSLP07711 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSLP07711 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSLP07711 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSLP07711 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSLP07711 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSLP07711 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSLP07711 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSLP07711 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSLP07711 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSLP07711 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSLP07711 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSLP07711 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSLP07711 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSLP07711 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSLP07711 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSLP07711 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSLP07711 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSLP07711 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTSLP07711 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms