Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYBBP04839 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYBBP04839 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYBBP04839 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYBBP04839 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYBBP04839 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CYBBP04839 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CYBBP04839 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYBBP04839 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYBBP04839 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYBBP04839 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYBBP04839 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CYBBP04839 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYBBP04839 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYBBP04839 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYBBP04839 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYBBP04839 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYBBP04839 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYBBP04839 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYBBP04839 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYBBP04839 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYBBP04839 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYBBP04839 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYBBP04839 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYBBP04839 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYBBP04839 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYBBP04839 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYBBP04839 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYBBP04839 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYBBP04839 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYBBP04839 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYBBP04839 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYBBP04839 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYBBP04839 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYBBP04839 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYBBP04839 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYBBP04839 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYBBP04839 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYBBP04839 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYBBP04839 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYBBP04839 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYBBP04839 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYBBP04839 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYBBP04839 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYBBP04839 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYBBP04839 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYBBP04839 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYBBP04839 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CYBBP04839 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CYBBP04839 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYBBP04839 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYBBP04839 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYBBP04839 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYBBP04839 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYBBP04839 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYBBP04839 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CYBBP04839 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYBBP04839 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYBBP04839 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYBBP04839 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYBBP04839 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYBBP04839 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYBBP04839 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYBBP04839 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYBBP04839 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYBBP04839 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYBBP04839 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYBBP04839 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYBBP04839 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYBBP04839 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYBBP04839 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYBBP04839 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYBBP04839 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYBBP04839 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYBBP04839 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYBBP04839 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYBBP04839 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYBBP04839 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYBBP04839 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYBBP04839 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYBBP04839 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYBBP04839 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYBBP04839 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYBBP04839 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYBBP04839 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYBBP04839 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYBBP04839 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYBBP04839 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYBBP04839 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CYBBP04839 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYBBP04839 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYBBP04839 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYBBP04839 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYBBP04839 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYBBP04839 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYBBP04839 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYBBP04839 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYBBP04839 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYBBP04839 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYBBP04839 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms