Protein–RNA interactions for Protein: P01891

HLA-A, HLA class I histocompatibility antigen, A-68 alpha chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-AP01891 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-AP01891 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms