Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSO75390 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CSO75390 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSO75390 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSO75390 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSO75390 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSO75390 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSO75390 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSO75390 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSO75390 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSO75390 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSO75390 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSO75390 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSO75390 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSO75390 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSO75390 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSO75390 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSO75390 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CSO75390 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CSO75390 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CSO75390 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSO75390 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSO75390 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSO75390 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSO75390 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSO75390 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSO75390 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSO75390 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSO75390 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSO75390 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSO75390 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CSO75390 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CSO75390 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CSO75390 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CSO75390 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSO75390 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSO75390 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSO75390 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSO75390 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSO75390 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSO75390 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSO75390 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSO75390 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSO75390 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSO75390 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSO75390 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CSO75390 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSO75390 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CSO75390 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSO75390 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CSO75390 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSO75390 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSO75390 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSO75390 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSO75390 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSO75390 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSO75390 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSO75390 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSO75390 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSO75390 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSO75390 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CSO75390 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSO75390 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSO75390 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CSO75390 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSO75390 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSO75390 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSO75390 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSO75390 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSO75390 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSO75390 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSO75390 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSO75390 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSO75390 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSO75390 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSO75390 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSO75390 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSO75390 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSO75390 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSO75390 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSO75390 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSO75390 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CSO75390 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSO75390 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSO75390 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CSO75390 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSO75390 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSO75390 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSO75390 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSO75390 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSO75390 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSO75390 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSO75390 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CSO75390 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CSO75390 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSO75390 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSO75390 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSO75390 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSO75390 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSO75390 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms