Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA2O43921 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms