Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM6BO15054 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms