Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EBAG9O00559 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms