Protein–RNA interactions for Protein: A8MUA0

Putative UPF0607 protein ENSP00000381514, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MUA0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A8MUA0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A8MUA0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A8MUA0 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
A8MUA0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A8MUA0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A8MUA0 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A8MUA0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A8MUA0 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A8MUA0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A8MUA0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MUA0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MUA0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MUA0 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MUA0 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MUA0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MUA0 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MUA0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MUA0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MUA0 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MUA0 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MUA0 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MUA0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MUA0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MUA0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MUA0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MUA0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MUA0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MUA0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MUA0 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MUA0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MUA0 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MUA0 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MUA0 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MUA0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MUA0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MUA0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MUA0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MUA0 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MUA0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MUA0 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MUA0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MUA0 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MUA0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MUA0 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MUA0 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MUA0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MUA0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MUA0 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MUA0 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MUA0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MUA0 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MUA0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MUA0 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MUA0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MUA0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MUA0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MUA0 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MUA0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MUA0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MUA0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MUA0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MUA0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MUA0 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MUA0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MUA0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MUA0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MUA0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MUA0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MUA0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MUA0 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MUA0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MUA0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MUA0 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MUA0 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
A8MUA0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
A8MUA0 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
A8MUA0 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
A8MUA0 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
A8MUA0 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
A8MUA0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
A8MUA0 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
A8MUA0 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
A8MUA0 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
A8MUA0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
A8MUA0 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
A8MUA0 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
A8MUA0 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
A8MUA0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
A8MUA0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
A8MUA0 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
A8MUA0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
A8MUA0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
A8MUA0 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
A8MUA0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
A8MUA0 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
A8MUA0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
A8MUA0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
A8MUA0 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
A8MUA0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms