Protein–RNA interactions for Protein: A6NN92

GJE1, Gap junction epsilon-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJE1A6NN92 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GJE1A6NN92 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms