Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms