Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GOLGA6L9A6NEM1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms