Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms