Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMED7Q9Y3B3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms