Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBE1Q9UJT0 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms