Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0R6

GSKIP, GSK3B-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSKIPQ9P0R6 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GSKIPQ9P0R6 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms