Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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