Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms