Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RHBDL2Q9NX52 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms