Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMC4Q9NTJ3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms