Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR64

KLHL1, Kelch-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL1Q9NR64 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
KLHL1Q9NR64 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL1Q9NR64 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL1Q9NR64 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL1Q9NR64 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL1Q9NR64 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL1Q9NR64 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL1Q9NR64 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL1Q9NR64 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL1Q9NR64 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL1Q9NR64 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL1Q9NR64 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL1Q9NR64 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL1Q9NR64 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL1Q9NR64 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms