Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms