Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GFRA4Q9GZZ7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms