Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms