Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms