Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIFKQ9BYG3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms