Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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