Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CMSS1Q9BQ75 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CMSS1Q9BQ75 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms