Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SORCS2Q96PQ0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.3 ms