Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRP3Q96P20 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms