Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SENP8Q96LD8 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms