Protein–RNA interactions for Protein: Q96I99

SUCLG2, Succinate--CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2Q96I99 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUCLG2Q96I99 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SUCLG2Q96I99 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUCLG2Q96I99 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUCLG2Q96I99 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUCLG2Q96I99 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUCLG2Q96I99 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUCLG2Q96I99 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUCLG2Q96I99 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUCLG2Q96I99 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUCLG2Q96I99 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUCLG2Q96I99 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUCLG2Q96I99 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms