Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY0

ZC2HC1A, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1AQ96GY0 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZC2HC1AQ96GY0 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZC2HC1AQ96GY0 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZC2HC1AQ96GY0 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZC2HC1AQ96GY0 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ZC2HC1AQ96GY0 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ZC2HC1AQ96GY0 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ZC2HC1AQ96GY0 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZC2HC1AQ96GY0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms