Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOBEC4Q8WW27 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms