Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV41

SNX33, Sorting nexin-33, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX33Q8WV41 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX33Q8WV41 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX33Q8WV41 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms