Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC12Q8WUD4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC12Q8WUD4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms