Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRSK1Q8TDC3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms