Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHE23Q8NDY6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHE23Q8NDY6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms