Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC191Q8NCU4 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC191Q8NCU4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC191Q8NCU4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC191Q8NCU4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC191Q8NCU4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC191Q8NCU4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC191Q8NCU4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC191Q8NCU4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC191Q8NCU4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC191Q8NCU4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC191Q8NCU4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC191Q8NCU4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC191Q8NCU4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC191Q8NCU4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC191Q8NCU4 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC191Q8NCU4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC191Q8NCU4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC191Q8NCU4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC191Q8NCU4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC191Q8NCU4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC191Q8NCU4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC191Q8NCU4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC191Q8NCU4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC191Q8NCU4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC191Q8NCU4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC191Q8NCU4 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC191Q8NCU4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC191Q8NCU4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC191Q8NCU4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC191Q8NCU4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC191Q8NCU4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC191Q8NCU4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC191Q8NCU4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms