Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNBD1Q8NA66 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNBD1Q8NA66 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNBD1Q8NA66 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CNBD1Q8NA66 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNBD1Q8NA66 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNBD1Q8NA66 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNBD1Q8NA66 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNBD1Q8NA66 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CNBD1Q8NA66 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNBD1Q8NA66 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNBD1Q8NA66 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CNBD1Q8NA66 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNBD1Q8NA66 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CNBD1Q8NA66 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNBD1Q8NA66 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNBD1Q8NA66 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNBD1Q8NA66 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNBD1Q8NA66 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CNBD1Q8NA66 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNBD1Q8NA66 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNBD1Q8NA66 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNBD1Q8NA66 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNBD1Q8NA66 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNBD1Q8NA66 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNBD1Q8NA66 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNBD1Q8NA66 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNBD1Q8NA66 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNBD1Q8NA66 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNBD1Q8NA66 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNBD1Q8NA66 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNBD1Q8NA66 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNBD1Q8NA66 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNBD1Q8NA66 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNBD1Q8NA66 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CNBD1Q8NA66 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNBD1Q8NA66 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNBD1Q8NA66 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CNBD1Q8NA66 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNBD1Q8NA66 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNBD1Q8NA66 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNBD1Q8NA66 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNBD1Q8NA66 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CNBD1Q8NA66 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CNBD1Q8NA66 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNBD1Q8NA66 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNBD1Q8NA66 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNBD1Q8NA66 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNBD1Q8NA66 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNBD1Q8NA66 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNBD1Q8NA66 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNBD1Q8NA66 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNBD1Q8NA66 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNBD1Q8NA66 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNBD1Q8NA66 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNBD1Q8NA66 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNBD1Q8NA66 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNBD1Q8NA66 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNBD1Q8NA66 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNBD1Q8NA66 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNBD1Q8NA66 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNBD1Q8NA66 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNBD1Q8NA66 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNBD1Q8NA66 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNBD1Q8NA66 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CNBD1Q8NA66 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNBD1Q8NA66 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNBD1Q8NA66 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNBD1Q8NA66 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNBD1Q8NA66 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNBD1Q8NA66 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNBD1Q8NA66 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNBD1Q8NA66 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNBD1Q8NA66 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNBD1Q8NA66 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNBD1Q8NA66 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNBD1Q8NA66 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNBD1Q8NA66 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNBD1Q8NA66 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNBD1Q8NA66 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNBD1Q8NA66 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNBD1Q8NA66 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CNBD1Q8NA66 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CNBD1Q8NA66 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNBD1Q8NA66 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CNBD1Q8NA66 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNBD1Q8NA66 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNBD1Q8NA66 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CNBD1Q8NA66 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNBD1Q8NA66 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CNBD1Q8NA66 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNBD1Q8NA66 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNBD1Q8NA66 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNBD1Q8NA66 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNBD1Q8NA66 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNBD1Q8NA66 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNBD1Q8NA66 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNBD1Q8NA66 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNBD1Q8NA66 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNBD1Q8NA66 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms