Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN19Q8N6F1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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CLDN19Q8N6F1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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CLDN19Q8N6F1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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CLDN19Q8N6F1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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CLDN19Q8N6F1 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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CLDN19Q8N6F1 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
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CLDN19Q8N6F1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN19Q8N6F1 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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