Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC2Q8N158 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPC2Q8N158 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
GPC2Q8N158 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPC2Q8N158 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPC2Q8N158 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPC2Q8N158 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPC2Q8N158 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPC2Q8N158 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC2Q8N158 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC2Q8N158 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC2Q8N158 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC2Q8N158 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC2Q8N158 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC2Q8N158 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC2Q8N158 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC2Q8N158 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC2Q8N158 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC2Q8N158 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC2Q8N158 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC2Q8N158 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC2Q8N158 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC2Q8N158 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC2Q8N158 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC2Q8N158 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC2Q8N158 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC2Q8N158 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC2Q8N158 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC2Q8N158 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC2Q8N158 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC2Q8N158 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC2Q8N158 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC2Q8N158 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC2Q8N158 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC2Q8N158 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC2Q8N158 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC2Q8N158 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC2Q8N158 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC2Q8N158 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC2Q8N158 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms